Начинается второй период завоевания острова греками. На короткое время афинянам удалось подчинить большинство городов Кипра и установить власть греческих династий.
В Саламисе к власти пришел представитель династии Теокридов, царь Онейлос, пользовавшийся широкой военной помощью Афин. Он начал осаду Аматуса последнего города, где правили цари этно-киприотов.
Для помощи этно-кипрйотам Персия направила на остров сильный экспедиционный корпус и флот. В морской битве греческий флот одержал победу, но в решающей схватке на равнине у Саламиса ибъединенные силы греческих городов Кипра столкнулись с хорошо обученным персидским войском.
В разгар сражения спартанец Стаснор, перешел на сторону персов и увёл к ним боевые колесницы, основную ударную силу войск кипрских городов.
Онейлосу с отрядом отборных греческих наемников удалось пробиться через боевые порядки персов и убить их военноначальника Артибиоса.
Исход сражения решили воины Аматуса, этно-киприоты, сражавшиеся на стороне персов. Они окружили Онейлоса и убили его. Голова царя была, как военный трофей, доставлена в Аматус и позднее похоронена жрецами. Владычество Персии на Кипре было надолго восстановлено.
Пришедший к власти в Саламисе, царь Эвагорас I, а потом и его сын Никоклеос, были осторожными политиками, предпочитавшие балансировать между греческой партией и сторонниками персидской ориентации.
В 480 г. до н.э. 150 кипрских судов приняли участие в походе персидского царя Ксеркса в Грецию. Кипр оставался главной целью военных операций Афин.
В 478 г. до н.э. на острове вновь высадился афинский экспедиционный корпус, использовавший Кипр как базу для военного похода в Египет (как и 700 лет назад!). Несмотря на усилия афинян, потомки этно-киприотов, опираясь на персидскую поддержку, смогли удержать Аматус и Китион.
Только при наследниках царя Эвагораса завершилась культурная ассимиляция этно-киприотов. Греческий язык стал повсеместно использоваться для обучения и вытеснил этно-киприотский. Надписи на монетах Саламиса делались уже на греческом языке. Это способствовало развитию торговли с Грецией и процветанию греческого искусства на Кипре. Из охваченных войной Афин и Спарты, на более спокойный Кипр прибывали все новые и новые греческие переселенцы.
В 351 г. до н.э. цари Саламиса сделали еще одну попытку избавиться oт персидского владычества, поддержав восстание Финикии и Египта. Персы остались победителями. Поняв, что с ними не справиться, цари Кипра занялись внутренними проблемами, ожидая появления какой-то новой внешней силы, способной сокрушить персидскую сверхдержаву.
Одним из ярких представителей образованных людей Кипра того времени является Зенон Китионский. Он происходил из финикийской семьи, жившей в Китионе. Родившийся в 336 г. до н.э., Зенон получил образование в Афинах, где стал одним из членов Академии. Он собирал своих учеников в "стое", колонаде афинского коммерческого центра, "агоры". Поэтому его филосфское учение и получило название "стоическое". Большую часть жизни Зенон провел в родном Китионе, где умер в 246 г. до н.э.
Среди жителей острова, древние восточные культы постепенно вытеснил Греческий пантеон богов, особо расцвел эротический культ Афродиты. Вместе с тем, среди части населения острова сохранялась восточная культура, которая продолжала оказывать безусловное влияние на искусство и художественное творчество киприотов. Сформировался нео-кипрский стиль керамики, тракотовой скульптуры и ювелирных изделий.
Основными торговыми партнерами Кипра являлись: Греция, Египет, Левант, острова Эгейского моря и города Малой Азии. Кипрские товары наполняли регион Средиземноморья, попадали на Сицилию, во Фракию и в многочисленные славянские города Причерноморья и Крыма.